Die Markgräflerland-Klinik ist in das Qualitätssicherungssystem der Deutschen Rentenversicherung eingebunden. Deren System beinhaltet 6 Auswertungsthemen. Dies sind die Rehabilitandenbefragung, die Begutachtung der standardisierten Entlassberichte (Peer Review), die therapeutische Versorgung (KTL-Dokumentation), die Auswertung der Therapiestandards, die soziodemographische Auswertung der Rehabilitandenstruktur sowie die Auswertung des sozialmedizinischen Verlaufs in einem Zeitraum von zwei Jahren nach Ende der medizinischen Rehabilitation. In allen 6 Bereichen kann die Markgräflerland-Klinik überdurchschnittliche Ergebnisse (Bericht 2011) vorweisen.
Für einen potentiellen Patienten dürfte allerdings das Ergebnis der Rehabilitandenbefragung (8-12 Wochen nach Ende des Rehabilitationsaufenthalts) eine besondere Bedeutung haben. Im Zuge dieser Befragung werden 12 Fragenkomplexe, z. B. zur ärztlichen-, psychologischen-, therapeutischen- und pflegerischen Betreuung ausgewertet. In allen 12 Komplexen weist die Markgräflerland-Klinik bessere Ergebnisse auf als die Vergleichsgruppe. Davon werden 6 Bereiche als signifikant besser bewertet als bei der Vergleichsgruppe.